Čeprav MOC in MOF vsebujejo kovinske-organske koordinacijske vezi, obstajajo temeljne razlike:
Dimenzionalnost: MOC so 0-dimenzionalne diskretne molekule, medtem ko so MOF 2D ali 3D neskončno razširjena omrežja.
Topnost: večina MOC je topnih, medtem ko so MOF na splošno netopni.
Stabilnost: MOF imajo na splošno večjo toplotno stabilnost.
Osredotočenost na uporabo: MOC se odlikujejo po molekularnem prepoznavanju, medtem ko so MOF primernejši za shranjevanje plina.